Vyriausiosios tarnybinės etikos komisijos (VTEK) narys nuo 2012 metų lapkričio 8 dienos.

Virginijus Kanapinskas nuo 2017 metų kovo 20 dienos ėjo laikinojo VTEK pirmininko pareigas. 2018 metų balandžio 10 dieną Seimui V.Kanapinsko nepaskyrus nuolatiniu vadovu jis šių pareigų atsisakė.