Asociacija įkurta 1999 metais. Pirmuoju jos vadovu tapo A. Kuzmarkis, šias pareigas ėjęs iki šiol. Šįkart jis savo kandidatūros prezidento rinkimuose nebekėlė ir atstovavimą uostininkų interesams perleido kolegoms.
A.Kuzmarskis liko Asociacijos tarybos nariu. Be jo, į tarybą išrinkti Klaipėdos jūrų krovinių kompanijos „Klasco“ generalinis direktorius Audrius Pauža, „Klaipėdos nafta“ generalinis direktorius Rokas Masiulis ir bendrovės „Vakarų krova“ vadovas Gediminas Rimkus.
A.Pauža ir R.Masiulis išrinkti Asociacijos viceprezidentais.
Lietuvos jūrų krovos kompanijų asociacija yra visuomeninė organizacija, vienijanti visas 14 Klaipėdos uosto krovos kompanijų. Asociacija atstovauja savo narių interesams bendraujant su valstybinėmis ir vyriausybinėmis struktūromis, Klaipėdos valstybinio jūrų uosto direkcija, kitomis organizacijomis, aktyviai dalyvauja ruošiant ir teikiant pastabas, pataisas rengiamiems įstatymams ir vyriausybės nutarimų projektams, susijusiems su uosto veikla, jo konkurencingumo stiprinimu.