Civilinių laivų palydos ir apsaugos užduotis Karinėse jūrų pajėgose atlieka Karo laivų flotilės Patrulinių laivų divizionas, kurio užduotys yra patruliuoti Lietuvos Respublikos teritorinėje jūroje ir išskirtinėje ekonominėje zonoje, sulaikyti laivus pažeidėjus, vykdyti konvojavimo, paieškos, gelbėjimo ir kitas operacijas.
Lietuvos kariuomenės Karinių jūrų pajėgų laivai Lietuvos išskirtinėje ekonominėje zonoje paprastai taip pat eskortuoja ir į Klaipėdą ateinančius dujovežius su SGD kroviniu.
