Ž. Bartkus dirbti tarnyboje pradėjo 1999 m. birželio 1 d. Šiaulių valdyboje. Nuosekliai kildamas pareigose: nuo 2006 m. paskirtas STT Šiaulių valdybos viršininku, nuo 2011 m. – STT Vilniaus valdybos viršininku, nuo 2013 m. – STT direktoriaus pirmuoju pavaduotoju, 2018 m. jis paskirtas eiti STT direktoriaus pareigas.
„Galiu pasidžiaugti, kad per 24 tarnybos metus, iš kurių 5-erius buvau STT vadovu, kartu su komanda nuveikėme daug. Visų keturių STT krypčių – korupcinių nusikaltimų tyrimų, analitinės antikorupcinės žvalgybos, korupcijos prevencijos ir antikorupcinio sąmoningumo didinimo – vieningas veikimas, leido ne tik atskleisti ir prevenciškai užkirsti kelią galimiems korupciniams nusikaltimams, bet ir stiprinti visuomenės požiūrio į antikorupcinės aplinkos kūrimo svarbą Lietuvoje ir pasaulyje. Visus šiuos darbus atlikome kartu su kompetentinga komanda, todėl dėkoju jiems už didelį atsidavimą ir darbą tėvynei“ – sakė kadenciją baigiantis STT direktorius Žydrūnas Bartkus.
Per 5-erius vadovavimo metus buvo pasiekta reikšmingų pokyčių – prioritetiniu tikslu tapo sisteminių korupcinių nusikaltimų tyrimas, įtvirtinta nauja STT funkcija – analitinė antikorupcinė žvalgyba, priimtas naujas Korupcijos prevencijos įstatymas, sustiprintas tarptautinis bendradarbiavimas – pradėta vadovauti Europos antikorupciniam tinklui EPAC/EACN ir pasiekta, kad vienas svarbiausių skaidrumo forumų pasaulyje 2024 m. vyktų Lietuvoje.
Taip pat stiprintas ir antikorupcinis sąmoningumas – įkurta ir sėkmingai gyvuoja „Skaidrumo akademija“, organizuoti skaidrumo hakatonai, įdiegta ir nauja antikorupcinio švietimo elektroninio mokymo platforma.