Savo profesinėje veikloje J. Zykus buvo vienas iš polinių pamatų įrengimo technologijos Lietuvoje pradininkų. Už šią inovaciją buvo apdovanotas valstybine premija.
1991 m. įkūrė ir vadovavo sudėtingų pamatų įrengimo įmonei UAB „Vilniaus rentinys“. Jo vadovaujama įmonė apdovanota už 2008 ir 2010 metų Lietuvos metų gaminius. J. Zykus buvo ir kitų apdovanojimų laureatu.
Iš verslo pasitraukė prieš dešimtmetį ir aktyviai užsiėmė visuomenine veikla, rėmė įvairias pilietines iniciatyvas.
Įveikęs ne vieną gyvenimo iššūkį, porą pastarųjų dešimtmečių skyrė pasirinktai savo gyvenimo misijai – Vilniaus metro idėjos įgyvendinimui, buvo visuomeninės organizacijos „Metro sąjūdis“ įkūrėjas ir vadovas.
Atsisveikinimas su velioniu – Vilniaus laidojimo rūmų 1-ojoje salėje (Olandų g. 22) nuo trečiadienio 15 val. iki ketvirtadienio 13 val. Laidotuvės vyks Vilniuje, Sudervės katalikų kapinėse Viršuliškėse.