Nuo 2015 metų šioms pajėgoms vadovavusį flotilės admirolą Arūną Mockų pakeitė jūrų kapitonas Giedrius Premeneckas, iki šiol ėjęs Karinių jūrų pajėgų vadovybės štabo viršininko pareigas.
Karinių jūrų pajėgų vėliavos ir pareigų perdavimo ceremonijoje dalyvavo krašto apsaugos ministras Raimundas Karoblis, Lietuvos kariuomenės vadas generolas leitenantas Valdemaras Rupšys, Lenkijos karinių jūrų pajėgų vadas vice-admirolas Jarosław Ziemiański, Estijos karinių jūrų pajėgų vadas flotilės admirolas Jüri Saska, Latvijos karinių jūrų pajėgų vadas jūrų kapitonas Kaspars Zelčs, Lietuvos kariuomenės Gynybos štabo ir pajėgų atstovai.
Taip pat joje lankėsi su karinėmis jūrų pajėgomis bendradarbiaujančių savivaldybių merai, Lietuvoje reziduojančių užsienio valstybių gynybos atašė ir NATO sąjungininkų pajėgų Lietuvoje atstovai.
Ceremonijoje kalbėjęs Lietuvos kariuomenės vadas pabrėžė Karinių jūrų pajėgų svarbą užtikrinant Lietuvos teritorinių vandenų ir išskirtinės ekonominės zonos saugumą.
„Dėkoju flotilės admirolui Arūnui Mockui už jo pasiaukojančią penkių metų tarnybą, rūpestingą vadovavimą Karinėms jūrų pajėgoms. Naujajam vadui jūrų kapitonui Giedriui Premeneckui noriu palinkėti toliau tęsti pajėgų jūrinės aplinkos suvokimo vystymą, plėtoti jūrų uosto bei priekrančių apsaugos ir gynybos pajėgumus, vystyti turimus gebėjimus vykdyti jūrų operacijas, nustatytas gynybos planuose, užtikrinti nuolatinį ir vientisą jūros paveikslo sudarymą“, – sakė generolas leitenantas Valdemaras Rupšys.
Vado kadenciją baigiantis A. Mockus ceremonijos metu buvo apdovanotas Lietuvos kariuomenės medaliu „Už pasižymėjimą“. Už asmeninius nuopelnus įgyvendinant Baltijos valstybių karinių jūrų pajėgų bendradarbiavimo projektus jis taip pat apdovanotas Estijos karinių jūrų pajėgų I laipsnio „Auksinio inkaro“ medaliu ir Latvijos ginkluotųjų pajėgų I laipsnio medaliu už nuopelnus.
Penkerių metų vadovavimo kadenciją baigęs flotilės admirolas ir toliau tęs tarnybą Krašto apsaugos sistemoje.
Jūrų kapitonas Giedrius Premeneckas baigė Vokietijos karinę jūrų mokyklą bei Klaipėdos universiteto Jūreivystės institutą. Karinėse jūrų pajėgose nuo 1997 metų tarnaujantis karininkas yra buvęs fregatos F11 „Žemaitis“ raketinės-artilerinės kovinės dalies vadu, laivo „Kuršis“ vadu. 2016-2019 metais jis ėjo Lietuvos gynybos atašė Danijai, Norvegijai, Suomijai ir Švedijai pareigas.
Lietuvos Karines jūrų pajėgas sudaro keturi patruliniai laivai – „Žemaitis“, „Aukštaitis“, „Dzūkas“ ir „Sėlis“, keturi priešmininiai laivai – „Jotvingis“, „Sūduvis“, „Kuršis“ ir „Skalvis“ bei trys pagalbiniai laivai ar kateriai.
Taip pat pajėgose veikia Jūrų ir pakrančių stebėjimo bei Logistikos tarnybos, Povandeninių veiksmų komanda ir Mokymo bei Jūrų gelbėjimo koordinavimo centrai. Iš viso jose tarnauja daugiau kaip 600 karininkų, karių ir civilių darbuotojų.