Kilus gaisrui, Aplinkos apsaugos agentūros laboratorija išvyko paimti aplinkos oro mėginių bei atlikti kietųjų dalelių ir kitų teršalų matavimų. Taip pat buvo parengta artimiausių valandų teršalų sklaidos prognozė, kuri rodė galimą teršalų sklaidą ir poveikio zoną, t.y. kurioje teritorijoje gali būti padidėjusi teršalų koncentracija ore, jaučiamas degėsių kvapas.
Agentūros specialistai taip pat paėmė nuotekų/gesinimo vandens ėminius.
Kovo 27 d., vykstant gaisrui Panerių g. kietųjų dalelių KD10 1 val. koncentracija Savanorių pr. oro kokybės tyrimų stotyje buvo labai aukšta ir svyravo 131–694 µg/m³ , o paros KD10 koncentracija siekė 81 µg/m³ ir viršijo ribinę vertę (50 µg/m³).
3 vietose pavėjui nuo gaisro židinio, nešiojamais prietaisais išmatuotos labai aukštos lakaus organinio junginio benzeno pusės valandos koncentracijos, kurios svyravo 68 – 941 µg/m³ (metinė ribinė vertė 5 µg/m³).
Kovo 28 d. 1 val. KD10 koncentracija Savanorių pr. oro kokybės tyrimų stotyje dar buvo lygi 297 µg/m³, o 2–4 val. nakties kietųjų dalelių koncentracija jau sumažėjo iki saugaus lygio ir siekė tik 8–40 µg/m³.