Didžiojo ketvirtadienio mišios – tai Paskutinės vakarienės mišios. Ketvirtadienį į šias mišias Bernardinų bažnyčioje tikintieji ėjo ypač susikaupę. Didįjį ketvirtadienį prisimenama Paskutinė vakarienė, kurią Jėzus prieš nukryžiavimą valgė su savo mokiniais. Didysis ketvirtadienis – eucharistijos, arba šv. Mišių, įkūrimo diena. Paskutinės vakarienės metu ir buvo sumanyta eucharistija – Komunija arba Mišių auka, kuri vėliau buvo kartojama visose šv. Mišiose. Tada buvo įsteigta ir kunigystė, nes Jėzus sakė: „Darykite tai mano atminimui“, ir apaštalai visada kartojo tai, ką Jėzus darė.