Sostinėje, Pašilaičiuose, Medeinos gatvėje, bus statoma bažnyčia, kurios viso komplekso pagrindinė ašis bus aukštai iškilęs kryžius, primenantis popiežiaus ferulą (popiežiaus pastoralą, kryžiaus formos ganytojišką lazdą), o bažnyčios pastatas panašus į vyskupo mitrą (vyskupo liturginį galvos apdangalą, kuris simbolizuoja jam pavestos tarnystės galias Bažnyčioje).

Sklype numatoma įrengti ir popiežiaus Jono Pauliaus II vizito Lietuvoje įamžinimo muziejų, susitikimų ir mokymų erdves, diskusijų klubą, „Carito“ ir socialinės pagalbos centrą, vargstančiųjų valgyklėlę, Evangelizacijos ir katalikiškų medijų centrą, Liturgijos ir šlovinimo mokyklą, kultūros renginių ir krikščioniško teatro salę, parodų erdves, krikščioniškos literatūros biblioteką, vaikų dienos centrą, jaunimo, šeimų ir senjorų klubus, bendrystės kavinukę-skaityklą, žaidimų ir sporto, laisvalaikio ir poilsio erdves, gedėjimo ir atsisveikinimo erdves, asmeninių rekolekcijų ir dvasinio palydėjimo namus, kleboniją – Šv.Pilypo Nerio oratorijos namus, ūkines ir kitas bendruomenės reikmėms skirtas patalpas.

Šalia bažnyčios bus amfiteatras.

Bažnyčios ir sielovados centro viziją rengė jungtinė architektų grupė – studija „BALT-A“ ir „2L Architects“. 

Bažnyčiai numatoma suteikti Šv.Jono Pauliaus II vardą. Bažnyčia tarnaus ir kaip sielovados centras.